Resume Engineer

1

Eugen ******

******************** (mailto:********************)

phone: *************

phone: + Show contacts

OBJECTIVE

Computational physicist (main focus on the creation and implementation of physical computer models)
with vast teaching and programming experience.

EDUCATION

1986-1992: FACULTY OF PHYSICS, TARAS SHEVCHENKO NATIONAL UNIVERSITY OF KYIV, KYIV, UKRAINE.

B.S./M.S in Physics and Engineering (speciality: Optical and Opto-Electronic Systems and Devices). Diploma thesis:
” Calculation of the characteristics of layered structures using the surface polariton method.”

1995-1996:FACULTY OF RADIOPHYSICS, TARAS SHEVCHENKO NATIONAL UNIVERSITY OF KYIV, KYIV, UKRAINE.

M.S in Automation and Microprocessor Applications.

1996-2004: DEPARTMENT OF METAL PHYSICS, TARAS SHEVCHENKO NATIONAL UNIVERSITY OF KYIV, KYIV,
UKRAINE.

Ph.D. in Physics and Mathematics (Solid State Physics), Thesis ”Calculations of interatomic potential and interatomic
correlations in crystals with using the pseudopotentials”.

APPOINTMENTS

1992–1994: ENGINEER, RESEARCH TRAINEE,DEPARTMENT OF METAL PHYSICS,TARAS SHEVCHENKO NATIONAL
UNIVERSITY OF KYIV, KYIV, UKRAINE.
1997–2000: RESEARCH ASSOCIATE, TARAS SHEVCHENKO NATIONAL UNIVERSITY OF KYIV, KYIV, UKRAINE.
2000-2003: RESEARCHER,DEPARTMENT OF METAL PHYSICS,TARAS SHEVCHENKO NATIONAL UNIVERSITY OF
KYIV, KYIV, UKRAINE.
2003–2012: SUBSTITUTE LECTURER, LECTURER, DEPARTMENT OF METAL PHYSICS, FACULTY OF PHYSICS, TARAS
SHEVCHENKO NATIONAL UNIVERSITY OF KYIV, KYIV, UKRAINE.
2012-2015: RESEARCH FELLOW, SCHOOL OF ENGINEERING AND APPLIED SCIENCE, ASTON UNIVERSITY,
BIRMINGHAM, UK.
2015- to present: CONSULTANT FOR CHAIR OF THE BOARD OF THE AUDIT FIRM "TEST",KYIV, UKRAINE.

RESEARCH SKILLS AND EXPERIENCE

Hybrid Molecular Dynamic-Hydrodynamic simulation of biological system.
Development original method for data processing using hierarchical mapping systems.
Ab-initio calculation of pair potentials; calculation of structure and thermodynamic properties of metals,
semiconductors and binary alloys; calculation of interatomic correlations and phase transition conditions in alloys.
Analysis of relation between of the particle interactions and properties of crystals. Molecular dynamic simulation of
crystal lattice defects.

2

Development of practical approaches and modelling of complexity of molecular systems; analyse informational
contents of physical dynamics of molecular systems.

Perturbation theory, statistical-mechanics approaches and pseudopotential methods in calculations of atomic bonds
in crystal lattice.
Thermodynamic perturbation theory,development and calculation of physically grounded equation of state.

RECENT PROGRESS AND RESEARCH PLANS

THE ORIGINAL METHOD OF NESTED RECURRENT EQUATIONS IS INTRODUCED. USING IT, THE FOLLOWING
APPLICATIONS CAN BE FURTHER DEVELOPED:

• novel multiscale models and methods via hierarchical fractal approach;
• with smooth transformation of analytic forms of interatomic potentials for investigate phase transition

conditions

• discrete data processing and prediction on the basis of fractal mappings approach;
• a link between equation of state for liquids and gases in the high pressure region (which is based on statistical

mechanics, i.e., thermodynamic perturbation theory and integral equation theory) and mapping approach.

TEACHING AND MENTORING SKILLS

Teaching seminars and practice courses for Undergraduate students

Mechanics, Molecular Physic and Thermodynamic, Electricity and Magnetism, Programming Methods and Program
Packages, General Physics for Biologists.

Lecturing courses for Postgraduate students

Solid State Physics; Software Development and Simulation Methods in Physics (lecture course with tutorial has been
developed), Physical Methods in Criminalistics.

Supervised following M.S. students:

Olexandr Pryadko , National Taras Shevchenko University, Kyiv, Ukraine
Olexiy Glibov, Kyiv National Taras Shevchenko University/National Cancer Institute, Kyiv, Ukraine
Maksim Zelenskiy, Kyiv National Taras Shevchenko University/National Cancer Institute, Kyiv, Ukraine
Valery Dzubluk , Kyiv National Taras Shevchenko University, Kyiv, Ukraine
Olexandr Yevsukov , National Taras Shevchenko University Kyiv

PROGRAMMING SKILLS AND EXPERIENCE

Experience

development of calculation code for the project “Using next generation computers and algorithms for modelling the
dynamics of large biomolecular systems”.
development of software for discrete data processing;development of the software for ab-initio calculation of
interatomic potentials, development of the software for automatization of spectrophotometer.

Programming languages

Visual C++, C, FORTRAN, Python.
Programming packages: MATHEMATICA, Origin, LaTex, GROMACS, LAMMPS.

3

NATIONAL AND INTERNATIONAL COLLABORATION

Dr. Sergey Karabasov group, Queen Mary University of London, School of Engineering and Materials Science, UK.
Prof. Makoto Taiji group, Yokohama RIKEN Institute, Japan
Prof. Vasily Goloviznin group, Institute of Nuclear Safety, Moscow, Russia
Prof. V.Makara, Kyiv National University, Physics Faculty, Kyiv, Ukraine
Prof. Valery Yashchuk, Kyiv Taras Shevchenko National University, Physics Faculty, Kyiv, Ukraine
Dr. Yu.G. Gordienko,Professor, Department of Computer Engineering,National Technical University of Ukraine "Igor
Sikorsky Kyiv Polytechnic Institute", Kyiv, Ukraine
Prof. Nikolai Malomuzh group, Theoretical Physics Department, Odessa National Mechnikov University, Odessa,
,Ukraine
Dr. E.E. Zasimchuk, Laboratory of Deformation Processes Physics, Institute of Metal Physics, Kyiv, Ukraine

ARTICLES

1. E.******, Using hierarchical mappings for data analysis, to be submitted

2. E.******,B.Tocher, Flexible equation of state based on mappings ,to be submitted

3. E.******, Mapping system for describing Gaussian peak, to be submitted

4. E.******, Recurrent data interpolation using mappings, in preparation

5. E.******, Hierarchical mapping system for deconvolution and function transition, in preparation

6. I.Korotkin, S.Karabasov, D.Nerukh, A.Markesteijn, A.Scukins, V.Farafonov, and E.******, A Hybrid Molecular

Dynamics/Fluctuating Hydrodynamics Method for Modelling Liquids at Multiple Scales in Space and Time, The Journal of
Chemical Physics, 143, 014110 (2015)

7. A.Scukins, V.Bardik, E.******, and D.Nerukh,Molecular Dynamics implementation of BN2D or ‘Mercedes Benz’ water

model, Computer Physics Communications, 190, 129 - 138 (2015)

8. A.Scukins, D. Nerukh, E.******, S.Karabasov, and A.Markesteijn, Multiscale Molecular Dynamics/Hydrodynamics

implementation of two dimensional ‘Mercedes Benz’ water model, Eur.Phys.J., 224 (12), 2217-2238 (2015)

9. E.******, M.Taiji, A.Scukins, A.Markesteijn, S.Karabasov, and D.Nerukh, Visualising and controlling the flows in

biomolecular systems at and between multiple scales: from atoms to hydrodynamics at different locations in time and
space, Faraday Discussions, 169 (1), 285-302 (2014)

10. O.Gatsenko, L.Bekenev,E.******, Y.Gordienko From quantity to quality: massive molecular dynamics simulation

nanostructures under plastic deformation in desktop and service grid distributed computing. Computer Science 14 (1),
27-44 (2013).

11. V.Bardik, V.Gotsulskii, E.******, N.Malomuzh, D.Nerukh, I.Yanchuk, S.Lavoryk Light scattering study of human serum

albumin in pre-denaturation: Relation to dynamic transition in water at 42C, Journal of Molecular Liquids, 176, 60-64
(2012).

12. V.Yu.Bardik, D.Nerukh, E.******, M.Vlasyuk, Free energy functional expansion as the generalized approach to the equation

of state of dense fluids, Ukrainian Journal of Physics, 57 (6), 612-618 (2012).

13. V.Yu.Bardik, D. Nerukh, E.******, M.Vlasyuk, and I.Zhyganiuk, Equation of state for water in the small compressibility

region, Ukrainian Journal of Physics, 57 (1), 49-53 (2012).

14. E.******, V. Makara, The effect of the pair interatomic interaction potentials on ordering in alloys with fcc structure. The

Herald of Taras Shevchenko National University of Kyiv (Physico-Mathematical Sciences), 55, 49-53 (2011).

15. E.******, V.Makara, Computer simulation methods in solid state physics, Kyiv Taras Shevchenko National University press,

Kyiv, 2010, 215p.

16. E.******, V.Makara, Ab-initio potential: hydrogen-hydrogen, The Herald of Taras Shevchenko National University of Kyiv,

(Physico-Mathematical Sciences), 55, 9-13 (2011).

4

17. E.******, V.Makara, Calculation of energy differences for polytipic silicon carbide modifications using the

Bashelet-Hamann-Shluter pseudo-potentials, Functional Materials, 10 (3), 439-443 (2003).

18. E.******, S.Repetskiy, V.Makara, Analysis temperature-concentration dependence of long-range ordering far off point of

phase transformation in alloys with fcc structure. The Herald of Taras Shevchenko National University of Kyiv
(Physico-Mathematical Sciences), 43, 28-32 (2001).

19. E.******, S.Repetskiy, T.Shatniy, V.Makara, Going out from approximation of mean field in ab initio calculations of pair

correlation. The Herald of Taras Shevchenko National University of Kyiv (Physico-Mathematical Sciences), (2001).

20. E.******, S.Repetskiy, V.Makara, Temperature and concentration dependence of long-range ordering in alloys with fcc

structure. The Herald of Taras Shevchenko National University of Kyiv (Physico-Mathematical Sciences), 42, 45-49 (2001).

21. E.******, S.Repetskiy, V.Makara, Investigation method of interatomic correlations parameters on the basis ab-initio

electron-ion Bachelet-Hamann-Sluter pseudopotentials, The Herald of Taras Shevchenko National University of Kyiv
(Physico-Mathematical Sciences), 39, 18-22 (1998).

CONFERENCES

1. S.Karabasov, D.Nerukh, A.Scukins, E.******, A.Markesteijn, P.Tabaee, M.Taiji Modelling solutions of biomolecules at

atomistic and continuum representation at the same time: hybrid MD/hydrodynamics framework, CCPBioSim / CCP5
Multiscale Modelling Conference (Manchester, UK, 2014)

2. E.******, M.Taiji, A.Scukins, I.Korotkin, A.Markesteijn, S.Karabasov, D.Nerukh, Visualising and controlling the flows in

biomolecular systems at and between multiple scales: from atoms to hydrodynamics at different locations in time and
space, Faraday Discussion 169: Molecular Simulations and Visualization (Nottingham, UK, 2014)

3. D.Nerukh, A.Scukins, E.******, S.Karabasov, A.Markesteijn,Hybrid molecular dynamics - hydrodynamics framework for

modelling liquids,Liquids 2014 (Lisbon, Portugal, 2014)

4. D.Nerukh, S.Karabasov, A.Scukins, E.******, I.Korotkin, V.Farafonov, and M.Taiji, Hybrid molecular

dynamics–hydrodynamics framework for modelling liquid molecular systems,EMLG - JMLG annual meeting 2014 (Rome,
Italy, 2014)

5. D.Nerukh, S.Karabasov, A.Scukins, E.******, I.Korotkin, V.Farafonov, and M.Taiji, Hybrid molecular

dynamics–hydrodynamics approach for multiscale modelling of liquid molecular systems, 10th Congress of the World
Association of Theoretical and Computational Chemists (WATOC 2014) (Santiago, Chile, 2014)

6. D.Nerukh, S.Karabasov, A.Scukins, E.******, I.Korotkin, V.Farafonov, and M.Taiji, Hybrid molecular

dynamics–hydrodynamics approach for multiscale modelling of liquid molecular systems, 10th Congress of the World
Association of Theoretical and Computational Chemists (WATOC 2014) (Santiago, Chile, 2014)

************* grid workshop, Krakow, Poland,November ********

8. Generalized approach to the equation of state of dense fluids and dilute gases // 19-th European Conference on

Thermophysical Properties, August ******************st, 2011, Thessaloniki, Greece.

9. Generalized approach to the equation of state of dense fluids and dilute gases // 19-th European Conference on

Thermophysical Properties, August ******************st, 2011, Thessaloniki, Greece.

10. Equation of state of dense fluids in the high pressure–high temperature region //International Conference on Statistical

Physics, Larnaca, Cyprus, 11–**************

11. The pecularities of migration of electronic excitations in nanosystems of synthetic and biological origin Ukrainian-German

Symposium on Physics and Chemistry of Nanostructures and on Nanobiotechnology, Beregove, Crimea, Ukraine,
September, **********

12. Self-organization of regular surface patterns on nano and micro scales from random nanoextrusions Ukrainian-German

Symposium on Physics and Chemistry of Nanostructures and on Nanobiotechnology, Beregove, Crimea, Ukraine 6th -
********************.

13. International Conference and FP6 Brokerage Event “Research on Surface Transport – HUNPOL TRANS” 19-20 May

2005, Budapest, Hungary.

5

14. Calculation method for temperature and concentration dependence of ordering parameters in binary alloys. Modern

problems solid state physics, 2010, Kiev, Ukraine

15. International Symposium Ordering in Metal and Alloys Kiev, Ukraine, November, ***********.

16. Calculation interatomic potential in covalent materials 3-th International Conference Optic and High Technology Material

Science, Kyiv, Ukraine, October 2002, Scientific works, p.183

17. TH-2002 International Conference on Theoretical Physics, UNESCO, Paris, 22-*************, Book of abstracts, p.269

Wyrażam zgodę na przetwarzanie moich danych osobowych w celu rekrutacji zgodnie z art. ******** lit. a Rozporządzenia
Parlamentu Europejskiego i Rady (UE) 2016/679 z dnia **************** r. w sprawie ochrony osób fizycznych w związku z
przetwarzaniem danych osobowych i w sprawie swobodnego przepływu takich danych oraz uchylenia ***************/WE
(ogólne rozporządzenie o ochronie danych)